НИВЦ МГУ
имени М. В. Ломоносова
  • Научно-исследовательский
    вычислительный центр
    Московского государственного
    университета имени М. В. Ломоносова

    Семинар "Суперкомпьютерные технологии в науке, образовании и промышленности", 7 ноября 2024 г.

  • 18 октября 2024

    Продолжает свою работу семинар "Суперкомпьютерные технологии в науке, образовании и промышленности". Первое заседание семинара в этом учебном году пройдет 7 ноября (c 16:20) в смешанном формате: в форме вебинара на платформе Контур.Толк и в конференц-зале НОЦ "Суперкомпьютерные технологии" МГУ (http://agora.guru.ru/display.php?conf=sct&page=place).

    Для участия в семинаре просим Вас заполнить форму:
    https://forms.yandex.ru/cloud/67110553eb61464934cbb2d5/

    На указанный Вами адрес электронной почты впоследствии придёт ссылка на конференцию в Контур.Толк (https://kontur.ru/talk).
    Обращаем Ваше внимание, что для более высокого качества видеосвязи мы рекомендуем заранее установить приложение Контур.Толк и заходить в конференцию через приложение, НЕ через браузер. Для участия в конференции регистрация в Контур.Толк НЕ требуется.
    Приложения (десктоп и мобильное), можно скачать по ссылке https://kontur.ru/talk#app.

    Если Вы планируете очно участвовать в работе семинара, и у вас нет пропуска в МГУ, необходимо не позднее 4 ноября (понедельник) заполнить форму. Обращаем внимание, что проход будет разрешен только через южный вход Второго корпуса МГУ и только во время работы семинара.

    Программа семинара 7 ноября 2024 г., 16:20

    Гудимчук Никита Борисович, д.ф.-м.н., с.н.с. кафедры биофизики физического факультета МГУ; зав. лаб. биофизики цитоскелета ЦТП ФХФ РАН
    Александрова В.В., м.н.с. кафедры биофизики физического факультета МГУ
    Фёдоров В.А., к.ф.-м.н., н.с. биологического факультета МГУ
    Холина Е.Г., к.б.н., ассистент биологического факультета МГУ
    Коваленко И.Б., д.ф.-м.н., в.н.с. биологического факультета МГУ
    Атауллаханов Ф.И., академик РАН, профессор, д.б.н., научный руководитель ЦТП ФХФ РАН; профессор Университета Пенсильвании

    "От молекул до клеток: компьютерное моделирование динамики микротрубочек на суперкомпьютере Ломоносов-2"

    Микротрубочки представляют собой полимеры белка тубулина, которые входят в состав клеточного скелета и играют важную роль в различных аспектах физиологии клеток. Их неравновесная динамика, необычные механические свойства, многообразие функций, а также медицинская значимость в качестве мишеней для препаратов химиотерапии рака на протяжении более тридцати лет стимулировали активные экспериментальные и теоретические исследования микротрубочек. В данном докладе будут представлены результаты компьютерного моделирования микротрубочек нашей группой за последнее десятилетие. Наши вычислительные усилия были направлены на понимание микротрубочек через набор моделей на нескольких пространственных и временных масштабах, начиная с изучения свойств димеров тубулина как строительных блоков и дальнейшего объяснения того, как эти свойства способствуют возникновению процессов на более крупных масштабах, таких как сборка/разборка и генерация сил микротрубочками. Методология включала различные подходы &
     #8212; от полноатомной молекулярной динамики до более "крупнозернистых" вариантов описания, таких как броуновская динамика и моделирование методом Монте-Карло. В докладе мы обсудим некоторые технические аспекты моделирования, такие как вычислительная производительность различных типов симуляций, текущие ограничения и перспективные направления для дальнейшего описания динамики микротрубочек, а возможно, и многих других клеточных систем, с использованием мульти-масштабного подхода.

    Программа, дополнительная информация о докладах, списки литературы:
    http://agora.guru.ru/display.php?conf=sct&page=item001
    Сайт семинара: http://agora.guru.ru/sct