Ф.В. Григорьев, А.Н. Романов, Д.Н. Лайков, С.Н. Жабин, А.Ю. Головачева, И.В. Оферкин, А.В. Сулимов, М.В. Базилевский, А.А. Багатурьянц, В.Б. Сулимов, М.В. Алфимов. Методы молекулярного моделирования супрамолекулярных комплексов: иерархический подход. // Росcийские нанотехнологии. 2010. Т. 5, № 5-6 С. 47-53.

Предложен оригинальный иерархический подход к определению структуры, устойчивости и свойств супрамолекул (СМ), образованных двумя и более молекулами (или молекулярными фрагментами наночастицы), с использованием методов молекулярного моделирования (ММ). Расчет структуры исходных компонент СМ осуществляется методами квантовой химии. Поиск возможных конфигураций СМ предложено осуществлять с использованием генетического алгоритма глобальной оптимизации и классического силового поля для расчета потенциальной энергии взаимодействия компонентов СМ. Для расчета уточненной геометрии найденных конфигураций, их относительной стабильности и требуемых свойств предложено снова использовать методы квантовой химии. Свободная энергия образования СМ может быть определена в квазигармоническом приближении с использованием молекулярно-динамического моделирования. Указанные выше методы и стратегия вычислений реализованы в программе INDAM, входящей в состав программного комплекса NANOMODEL для многомасштабного моделирования структуры и свойств наноразмерных комплексов.

Ключевые слова: Супрамолекулы, наночастицы, иерархический подход, методы молекулярного моделирования.